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夢の国・グランベルで機械たちと暮らす少年・シキは、１００年ぶりの来国者となる動画配信者の少女・レベッカと青猫のハッピーに出会う。すぐさま意気投合し、“友達”となったシキたち…この小さな出会いが、彼らの「運命」を大きく変えていく！！ まだ見ぬ世界に夢を乗せ、少年と少女と青猫の、果てしない冒険が始まった！！

「宇宙の女神・“マザー”に会いにいく」という壮大な目標を掲げた新米冒険者・シキとレベッカ、そしてハッピー。彼等は高性能の宇宙船を入手する為、レベッカとハッピーの恩人である老人・ワイズ博士を訪ねて惑星ノーマへと降り立った。しかしそこで、不測の事態が連発！！　ワイズと名乗る“若者”が現れ、窃盗団とは一悶着あり、さらにはノーマの異変が追い討ちをかけて！？　シキたちの冒険は、いきなり波瀾万丈！！

宇宙海賊エルシーからシキが譲り受けた戦艦は、魔王ジギーの船だった！　そして、魔王四煌星の一人・ウィッチに新たなる魔王として迎えられたシキは、マザーを目指す為に、残る三人の四煌星の捜索に乗り出す！　その一人、シスターの手がかりを求めて惑星ブルーガーデンに降り立ったシキたちはそこで、Ｂ・キューバーを狙った極悪犯罪に巻き込まれてしまう。しかし、この事件の裏にはシキたちの想像を超える混沌が待ち受けていた！

レベッカを救う為、悪党の巣窟・惑星ギルストに乗り込んだシキたちは、誘拐事件の実行犯である傭兵団・ローグアウトと激闘を繰り広げる。しかもその団長は、シキたちが捜している魔王四煌星の一人、「シスター」を名乗り…。そんな中、緊急事態が発生！！ 時を喰う宇宙の怪物・「時喰み」がギルストに急接近してきたのだ。ギルストに迫る終末の時…シキたちの運命は！？　そして「シスター」に隠された真実とは！？

三人目の魔王四煌星・ハーミットを救う為、実体は干渉できない超仮想惑星デジタリスにダイブ（デジタル化）し乗り込んだシキたち。しかしそこは、残虐な殺人鬼が跋扈する危険な惑星と化していた！！ しかも、仲間の裏切り(！？)や新たな敵(！？)がピンチに拍車をかけて…。この逆境の中でシキたちは、非道なる悪意によって壊された少女の心を取り戻せるのか！？

魔王四煌星最後の一人・ヴァルキリーを捜すシキたちは、ハーミットの助言に従って、時の惑星・ミルディアンを訪れる。そこで彼等を待っていたのは、“伝説の占い師”と呼ばれる謎の美女。銀河の全てを知るという彼女が、「ヴァルキリーの居場所」の対価としてシキたちに要求したものとは!? 一方、桜宇宙一の大悪党にして“闇の錬金術師”のドラッケン・ジョーがエデンズ ゼロに触手を伸ばして!?　果てしない宇宙の大冒険…シキたちの前途は想定不能!!

時詠みのシャオメイが告げたヴァルキリーの居場所、宝石の惑星サン・ジュエル。紅婦人が治めるその星は、煌びやかで宇宙一平和な星とされていたが……。罪人として「労働区」に送られたシキとホムラは、人々が迫害、搾取されている現実を目の当たりにする!! エデンズ ゼロへの欲望を露にする紅婦人。レベッカに協力するラビリア(!?)。そして現れる自称ヴァルキリーの弟子。数多の思いが交錯する中、ヴァルキリー、そしてホムラの哀しき“真実”が明らかに!!

ヴァルキリーは殺されていた。それも紅婦人の非道がゆえに。最愛の師匠が命を落とした元凶に実母がある“真実”に打ちのめされたホムラ。彼女の哀しみを胸にシキは単身敵地に乗り込み、紅婦人との直接対決に打って出る。労働区ではレベッカたちを三罪天が急襲。さらには金の匂いを嗅ぎつけたドラッケンまで介入し……。惑星サン・ジュエルを染める血と涙。その悲劇の歴史に終止符は打たれるのか!?

金の匂いを嗅ぎつけ、エデンズ ゼロをつけ狙う“闇の錬金術師”。紅婦人を打倒し、惑星サン・ジュエルを解放したシキたちは追われる立場から一転、ドラッケンの本拠たる巨大戦艦を目指す。反転攻勢の潜入作戦、その決断は吉と出るのか？ 凶と出るのか？ 激突！ チームEZ vs. 闇の錬金術師!! いま能力者同士の人知を超えた戦いの火蓋が切られる!!

狙撃されたワイズを救う「薬」を携え、ベリアル・ゴアに急行したレベッカとハッピー。だが、風のシルフに行く手を遮られ、二人は囚われの身に。さらには、駆けつけたシキとホムラの前にも、シルフとその兄ジンが立ち塞がるのだった……。風雲急を告げる“闇の錬金術師”との対決。逆境にあって、いよいよシキたちは闘志を漲らせるのだが……。彼等はまだ知らない、敵が想像も及ばぬ暗き“闇”であることを。

金の匂いを嗅ぎつけ、エデンズ ゼロをつけ狙う“闇の錬金術師”。紅婦人を打倒し、惑星サン・ジュエルを解放したシキたちは追われる立場から一転、ドラッケンの本拠たる巨大戦艦を目指す。反転攻勢の潜入作戦、その決断は吉と出るのか？ 凶と出るのか？ 激突！ チームEZ vs. 闇の錬金術師!! いま能力者同士の人知を超えた戦いの火蓋が切られる!!

狙撃されたワイズを救う「薬」を携え、ベリアル・ゴアに急行したレベッカとハッピー。だが、風のシルフに行く手を遮られ、二人は囚われの身に。さらには、駆けつけたシキとホムラの前にも、シルフとその兄ジンが立ち塞がるのだった……。風雲急を告げる“闇の錬金術師”との対決。逆境にあって、いよいよシキたちは闘志を漲らせるのだが……。彼等はまだ知らない、敵が想像も及ばぬ暗き“闇”であることを。

絶望の未来を覆せ！ レベッカの情報を武器に、ベリアル・ゴアへの突撃を強行するシキたち。任務はラビリアの救出。だが、突入した先に意外な人物が姿を現し……。さらにその先に待ち受けるは、精鋭・エレメント4、そして宿敵ドラッケン・ジョー。一度は完敗した相手との「敗北、即破滅」の戦いが始まる!!

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